Koja je razlika između PCR ploče s ravnim i okruglim dnom s 96 jažica?

Pozdrav, kolege laboratorijski entuzijasti! Kao dobavljač PCR ploča s 96 jažica, u zadnje vrijeme dobivam hrpu pitanja o razlici između PCR ploča s ravnim i okruglim dnom s 96 jažica. Pa sam mislio sjesti i napisati ovaj blog da raščistimo stvari.

Počnimo s osnovama. Ploča za PCR s 96 jažica glavna je namirnica u laboratorijima molekularne biologije. Koristi se za lančanu reakciju polimerazom (PCR), tehniku ​​koja pojačava specifične sekvence DNK. Ove ploče dolaze u dvije glavne vrste oblika bunara: ravnog dna i okruglog dna.

Ravne - dno 96 - PCR ploče s jažicama

PCR ploče s ravnim dnom i 96 jažica poput su radnih konja u svijetu PCR-a. Imaju jednostavan, jasan dizajn. Svaka jažica ima ravnu površinu na dnu, što ih čini super svestranim.

Jedna od najvećih prednosti ploča s ravnim dnom je njihova kompatibilnost s različitim metodama detekcije. Na primjer, ako koristite sustav detekcije temeljen na fluorescenciji, ravno dno pruža stabilnu površinu za ravnomjernu interakciju svjetlosti s uzorkom. To znači da dobivate preciznije i dosljednije rezultate. To je kao da imate savršeno ravnu pozornicu za nastup; sve jednostavno radi bolje.

Još jedna sjajna stvar kod tanjura s ravnim dnom je to što se u njih jednostavno pipetira. Ravna površina vam daje jasnu metu, tako da je manja vjerojatnost da ćete slučajno promašiti jažicu ili poprskati uzorak. Ovo je posebno važno kada radite s malim količinama, što je čest slučaj u PCR-u.

Međutim, ploče s ravnim dnom imaju nekoliko nedostataka. Oni obično imaju veću površinu na dnu bunara u usporedbi s pločama s okruglim dnom. To može dovesti do većeg isparavanja tijekom PCR procesa, posebno ako provodite dugi ili visokotemperaturni protokol. A ako radite s uzorcima koji se moraju koncentrirati na dnu jamice, ravna površina možda nije najbolja opcija.

Okrugle - dno 96 - PCR ploče s jažicama

PCR ploče s okruglim dnom i 96 jažica, s druge strane, imaju drugačiji oblik koji nudi vlastiti niz prednosti. Zaobljeno dno svake jažice pomaže da se uzorak koncentrira na najnižoj točki.

Ovaj učinak koncentracije je stvarno koristan kada imate posla s ograničenim količinama uzoraka. Osigurava da su svi reagensi i DNK u neposrednoj blizini, što može poboljšati učinkovitost PCR reakcije. To je kao da skupite sve svoje igrače u malo područje na terenu; mogu lakše komunicirati.

Ploče s okruglim dnom također imaju manju površinu na dnu bunara, što znači manje isparavanja. Ovo je veliki plus ako koristite PCR protokol koji zahtijeva dugo vrijeme inkubacije ili visoke temperature. Ne morate se toliko brinuti da će se vaši uzorci osušiti.

Ali tanjuri s okruglim dnom nisu bez svojih izazova. Može biti malo teže pipetirati u njih u usporedbi s pločama s ravnim dnom. Zakrivljena površina otežava postavljanje vrha pipete točno na dno udubljenja, a postoji i veći rizik od prskanja ili potpunog propuštanja udubljenja. Također, neki sustavi detekcije možda neće raditi tako dobro s pločama s okruglim dnom jer svjetlost ne stupa u interakciju s uzorkom na isti način kao s ravnom površinom.

Prijave

Sada, razgovarajmo o tome gdje svaka vrsta ploča blista u različitim primjenama.

Ploče s ravnim dnom

Ploče s ravnim dnom izvrsne su za primjene koje zahtijevaju točnu kvantifikaciju. Na primjer, u PCR-u u stvarnom vremenu, gdje mjerite količinu pojačanja DNK dok se događa, ravno dno osigurava da je signal fluorescencije dosljedan u svim jažicama. To omogućuje precizniju kvantifikaciju ciljne DNK.

Također se često koriste u probiru visoke propusnosti. Budući da ih je jednostavno pipetirati i kompatibilni su s većinom automatiziranih sustava za rukovanje tekućinama, možete brzo i učinkovito postaviti više PCR reakcija u jednoj ploči.

Ako ste zainteresirani za našePresavijena PCR ploča s 96 jažica, koji je vrsta ploče s ravnim dnom, nudi još više pogodnosti sa svojim sklopivim dizajnom.

Okrugle - donje ploče

Ploče s okruglim dnom idealne su za primjene gdje je koncentracija uzorka ključna. U PCR-u s jednom stanicom, gdje radite s iznimno malim količinama DNK iz pojedinačnih stanica, okruglo dno pomaže da se sav dragocjeni uzorak zadrži na jednom mjestu.

Također su dobar izbor za PCR reakcije koje su osjetljive na isparavanje. Na primjer, ako provodite PCR protokol s dugim korakom denaturacije na visokoj temperaturi, ploča s okruglim dnom može spriječiti isušivanje vaših uzoraka.

Cijena i dostupnost

Kada se radi o cijeni, nema velike razlike između PCR ploča s ravnim dnom i okruglim dnom s 96 jažica. Cijena obično više ovisi o marki, materijalu i kvaliteti ploče.

Što se tiče dostupnosti, obje su vrste široko dostupne na tržištu. Međutim, ploče s ravnim dnom općenito su češće zbog svoje svestranosti. Ali ne brinite, ako trebate tanjure s okruglim dnom, trebali biste ih lako pronaći.

Ako tražite i druge PCR potrošne materijale, mi nudimoPCR 4 - STRIPS TUBAiPCR 12 - STRIPS TUBA, koji su izvrsna alternativa za manje PCR reakcije.

Pravljenje pravog izbora

Dakle, kako odlučiti koja je vrsta tanjura prava za vaš eksperiment? Pa, sve se svodi na vaše specifične potrebe.

Ako provodite eksperiment visoke propusnosti koji zahtijeva točnu kvantifikaciju i koristite sustav detekcije temeljen na fluorescenciji, ploča s ravnim dnom je vjerojatno najbolja opcija. S druge strane, ako radite s ograničenim volumenima uzorka i trebate koncentrirati uzorak ili ako ste zabrinuti zbog isparavanja, ploča s okruglim dnom bi mogla biti prikladnija.

Također je dobra ideja napraviti mali test s obje vrste ploča ako je moguće. Na taj način možete vidjeti koji vam daje najbolje rezultate za vaš određeni PCR protokol.

Kontakt za kupnju

Ako ste zainteresirani za kupnju PCR ploča s 96 jažica ili bilo kojeg drugog našeg PCR potrošnog materijala, slobodno nam se obratite. Ovdje smo da vam pomognemo pronaći prave proizvode za potrebe vašeg laboratorija. Bez obzira trebate li tanjure s ravnim ili okruglim dnom, mi ćemo vas pokriti.

Reference

• Sambrook, J. i Russell, DW (2001). Molekularno kloniranje: laboratorijski priručnik. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
• Dieffenbach, CW i Dveksler, GS (2003). PCR početnica: Laboratorijski priručnik. Cold Spring Harbor Laboratory Press.